国家卫健委数据显示，9月20日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例72例。其中境外输入病例30例（云南12例，上海6例，江苏3例，广东3例，黑龙江2例，浙江2例，福建2例），含4例由无症状感染者转为确诊病例（浙江2例，福建1例，广东1例）；本土病例42例（均在福建，其中厦门市36例、莆田市5例、泉州市1例）。无新增死亡病例。新增疑似病例2例，均为境外输入病例（均在上海）。
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